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第73章 网络观点的读书笔记

布局篇:1找到自己的突破点,是决定优势。无人超越。2有效的规划,瞄准一定领域深耕。3广阔的知识背景和一定的专精领域。4超越时代的眼光和远大的理想。5高维的思想,不限制眼前得失,着眼更大的图景。如小白鼠的特定变化可以与不同领域的知识联系从而构建等价的逻辑,如钙离子通道等等分子层次6脚踏实地的学习方法和努力,要突破学习的障碍。7合理分配资源,如时间,精力等等,要自己重视自己的价值。8资金先行。

技术篇:1循环的系统需要多层次的耦合才能形成稳定的网络结构,重要的是拥有博弈竞争的环境才能形成对环境适应度最大的结构。2足够的分辨率是网络研究的基础,如同显微镜造就的病理切片是对宏观疾病的不动点式的表达。这是仪器的胜利,对测定的重视,是定量分析的基础。如分光光度法就是一种对物质性质的宏观把握。3复杂结构的序列分解,将对象的关系分解为一定的序列组合,选择一定有意义的模式。即多参数,比例确定。

思想篇:1分形结构能够在有限的空间构建更大的低维结构,如海岸线的测量精度越大,路径越长,而面积变化不大。2中心法则的力量在微生物层次体现得更加明显,这是我们可以利用的特点。3分形结构的层次相似性提示我们蛋白质之间的关系也可以形成一定的路径,如酶和辅酶的依赖性。4自然语言的意思确定是波函数坍缩的过程,语义不断缩小,信息的推论是贝叶斯方法的。认知边界。

感想篇:1紧跟发展的潮流,主动挖掘问题。努力尝试科研成果的转化。2多方面地理解接近问题,这是网络的多层次分化。3经济学的思想是理性人的做法,要把握,这是理解复杂世界的基础。4勇于当弄潮儿,突破已有的模式。5注重边际效益,当降到一定程度时应该及时止损。6简洁不是简单,而是对网络不动点的清晰认识。7做研究第一步就是文献调研,站在巨人的肩膀上。然后再进行一定的组合和筛选。最后形成有意义的模式。8抓住不可替代的重点,成为多层次依赖的核心。

布局篇:1勇于借鉴前人的经验,这是我们发展的基础,另辟蹊径需要知道已有的道路。2英语学习的重要性。3文献调研可以收缩研究范围,利于集中资源,从而能够在大规模的筛选中找到最佳的模式。4良好的基础和明确的方向感。

技术篇:1利用中心法则的底层通用性,这是基因工程的基础,可以使得特定的性质转移到不同的物种如微生物来生产,从而构建动物植物微生物的等价路径。2严格的研发链条是高维结构,围绕着核心技术,建立一连串的关键技术,再用一连串的技术围绕一连串的关键技术。3完整的实验记录和标准化处理4分子机理研究,把宏观的关系分解,如钠钾离子通道的阻滞剂对心律失常,高血压等等疾病有一定的疗效,就可以研究各种离子通道蛋白(不动点)的作用及其综合,因为我们需要集中力量于有限的范围但同时不能忽略其他的相互作用,因此采取求偏导的方法,概率等于导数。4稳定的发挥作用,需要一定的耦合对,如激动剂和拮抗剂的竞争博弈。5克隆是一种基本动力,使得特异性显现,如同PCR和自然选择。6准确的分类可以使得序列运算的对象减少,从而得出的结果更具相关性。6通过突变和正常的序列进行各个层次的比较可以得出低层次的变异的作用。7基础技术的构建,通过条件的限定对特定性质的放大,这是平衡的移动。

思想篇:1基因的显隐性与性状的选择性表达,其机制与马尔科夫序列相似。杂交是实验的方法,可以揭示各种关系,从而构建路径。2中心法则对蛋白与基因的等价关系构建提供理论基础,我们可以通过研究基因序列来部分理解蛋白质的性质。3方向比努力重要的前提是已知这个方向是未来的实现,不然就只能通过贝叶斯公式来堆积概率。4精确的测量,单分子层次等等低维层次可以遍历形成高维结构。5层次的交互作用使得网络只能在模块层次以宏观的机械类比,事实上网络的模块具有一定的代偿性质,因此我们只能在统计层次观测各种影响。6序列耦合导致的诱导效应,如同启动子和引物。7正反馈的形成与其他反馈机制的比例是分布的宏观结构。8分形结构与网络的序列表达都是不断细化的过程,如同还原论,然后需要以博弈论来进行层次的遍历从而形成整体结构。即我们考虑不同层次的相互作用,基因层次偏表达调控,蛋白层次偏相互作用。

感想篇:1实验和实验体现的逻辑是硬通货。2研究方向是前进的方向,是任务分解的基础,在A_B的关系形成中找到具体的路径。3模块化,复杂的技术最后变成一个基本的步骤,这就是进步。

布局篇:1前期准备要充分2照顾各方的利益。3捆绑利益方。

技术篇:1对照实验对序列的效应比较。2多层次耦合的关系体现于不同层次的拮抗协同关系,如α1抗胰蛋白酶对蛋白水解酶的拮抗,而蛋白水解酶对一般蛋白的拮抗,这是相互耦合的序列,最后可以形成一定的分形结构。可以投影到更高维度的变化,只是比例不同。3观测需要对象的差异,没有差异就创造差异,如病理切片的染色。4分化是多层次的竞争博弈形成的一定均衡,其是动态变化的,这就是我们个体特异性的原因。需要考虑很多的矛盾,但资源有限,机体很大一部分是处于浪费状态,但作为储备对整体利益更好,可以随时选择性表达出对环境适应度最好的状态,这是自然选择的原理。当然我们可以把握高维结构,即层次的相似性,然后在这个基础上运算。这就是不动点。如肺动脉高压是肺源性心脏病的关键,即不动点。这也是机体的健康和疾病状态的根源。5组合的模式识别,以正常情况构建数据库,考虑多方面的因素如细胞类型,形态变化,数目比例,排列组合等等人脑在潜意识层次运算的层次,然后提取出更高维度的关系,如病理的诊断。这是仿照神经网络的大规模运算。6微积分的无穷小量,其加和是分形结构。细胞层次的集合发挥的力量,如心肌。7假小叶形成与我们希望在恶性肿瘤边界形成一定的包膜可能有一定的指导意义,其特定的基因表达模式的移植有助于恶性肿瘤良性化。8活性物质的准备,可以作为一种不动点。

思想篇:1序列的底层运算,与中心法则的分形结构相配。各种复杂的活动,如复制等等与函数建立一定的映射关系。2引物的启动机制,这是如同能量的破坏原有闭环耦合结构。3从基础做起,局部最优堆积形成接近整体最优。4大规模的试错才能找到具体的作用路径,如同遍历后的路径坍缩。然后就是算法优化,如正交实验的线性无关量,基于经验的贝叶斯公式,局部最优的动态规划等等。5特异性可以是具体的路径形成的关键,如同桥梁连接不同的关系形成高维结构。引物的特异性序列是扩增的基础。6催化剂与酶的结构的类比,可以理解为序列的匹配运算,这是一种不动点,是综合环境的选择性表达。7自动化和检测仪的出现是挂钩的。光作为工具能够最大程度实现大规模检测。

布局篇:1药物的研发是机制研究的验金石,能不能以一定的结构组合来对特定的靶点进行影响。2不可替代性是个体的追求,对于健康的群体则是希望个体的可替代性,这种矛盾达成的均衡是不同社会的宏观结构。3升级,更高维度的视角,从竞争到创造,开枝散叶。正反馈的形成有助于自身的不断提高。

技术篇:1筛选,路径的坍缩,如同自然选择。大规模的试错,可以参照一定的经验来降低失败的概率。2序列的影响就是控制因素。基于人体网络的药物动力学和药效学说选择性表达的结果。我们需要对序列运算即需要分解为不同的模块,如不是简单的抑制或者激活,而是需要构建多层次的关系。

思想篇:1工业的催化剂与蛋白酶的相似性启发我们对药物的新看法。2在合适的时候干合适的事,因为多层次耦合所涌现的窗口期很短,即我们能够施加影响的时间很短,需要好好把握。3序列的思想在于多变量的考虑,可以选择不同度量的标准来形成不同的路径。这种序列的自耦合可以涌现不同的性质。4疾病等等宏观结构可以根据分形几何的假设同样分解为一定的序列,对于序列的影响只有代入新的序列。至于药物则是不动点式的序列。5组学的整体论是系统的发现,也是网络的发展方向。

感想篇:1尝试尝试尝试,这是关系的寻找,是模式涌现的基础。2逆向思维的运用。闭合的已知可以等价为开环的未知,这是网络的自反律的应用,基于高维结构的运算,如序列的耦合成环然后再切割。

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