第二天果然出现了大沙暴，幻影之塔也跟着出现，在幻影之塔出现的后小田卷博士他们开始准备进入幻影之塔，当然仁他们也在其中。
仁他们一行人走到幻影之塔，这座塔一石头结构，共三层。当然他们进入塔中，在塔的中间有着一个石台，石台上有着一些器皿，还有一些神奇宝贝的雕像，看起来是为了祭祀用的，看到这些东西小田卷博士他们这些研究员马上开始研究，而仁他们呢则是在塔中寻找看有没有什么发现，，结果没有任何发现。
在这一层没有发现，他们就想上二层寻找，就在他们想要去第二层的时候一个研究员告诉他们：“你们要上二层要小心一点，虽然第二层我们也探索过，可是我们并没有完全探索，所以你们要小心一点，注意危险。不过这座塔应该有第三层，可是我们几次探索都没有发现第三层的入口，真是奇怪，不过在第二层的东西不要乱碰，知道了吗？”
“好，知道了，谢谢你。”：仁他们说道，随后他们就上了第二层，在第二层仁他们没有在第一层那样随意，这一层显然比第一层的时候小心些了，转了一圈仁他们只在第二层找到和第一层差不多的东西后就没有任何其他的发现了，没有什么发现的仁他们决定寻找通往第三层的通道，可是再找了一圈没有发现后，包括以前没有探索的的地方，没有发现的人他们无奈放弃，他们垂头丧气的围在一起，仁说着：“不是说还有一层，可为什么没有路了，这不应该啊。”
“是啊，难道有什么机关吗？”：小瑶说道。
“机关！？”：仁和梦在听到小瑶的话后突然想到什么。
梦说道：“既然没有路，应该是有着什么机关。”于是就有发生了这一幕，三个人就像老鼠一样，四处乱窜，开始寻找着机关，可是在寻找了一圈后没有任何发现，他们再次聚集在一起，就在这个时候仁把扶在墙上，只听见“咔”的一声，仁好像摁到了什么，接着墙壁开始震动，这个震动就连在第一层的小田卷博士他们都感觉到了，他们察觉到这个震动是从第二层发出的，他们都放下手中的事情网第二层赶去，而在第二层的墙上竟然开始出现开始出现石阶梯，然后在石阶梯的尽头处开始出现一个翻盖门。
仁他们对视了一眼，他们都从对方的眼睛中看出了，震惊然后就是惊喜，他们都知道了这是第三层的通道，他们对视了一会儿他们走上了石阶梯，很快他们就打开了翻盖门，进入了第三层，就在他们进入第三层的时候墙壁上的石阶梯开始往回缩，很快就缩回了墙壁，而仁他们进入第三层的那个翻盖门也在次和第二层的房顶接合，看不出一点痕迹。
当小田卷博士他们赶到第二层的时候，看到空荡荡的第二层，没有仁他们的影子，这一下小田卷博士和一众研究员着急了，他们开始寻找仁他们，可是当他们把第二层找了个遍，也没有找到仁他们，这个时候小田卷也开始冷静了他想着：“仁他们，明明上来了这一层，可是这一层没有他们的影子，再加上刚才的震动应该是仁他们发现了什么，看来这个塔应该有着什么机关，还有就是没有听到任何的求救声，这表示他们应该没有遇到什么危险。”这么想着小田卷就把这些研究员分成两部分，一部分在二层考察，顺便寻找关于仁他们的踪迹，另一部分回到第一层把没有做完的研究继续做完。
这一边研究和找人都在进行，而在第三层仁他们也看到第三层的面目，第三层和第一、二层都不一样，在第三层只有一个石头堆成的平台，在这个平台上还有着两只石头的桌子，桌子上有着两块石头，这两块石头放在支架上，看的出来这两块石头被保护着，而且在这两个桌子旁边有着两个雕像，是两只不一样的神奇宝贝。
有一个雕像像是了一个盆栽，在雕像的表面有着一些花纹，而下面呢有着四个角的底座，中间有着一根很短的棍子，上面像是一个花盆，花盆边上有着几个像是触手一样的东西平均的分布在周围，不过在这些触手的中间有着两颗珠子，像是眼睛，不注意看的话更本看不出这是神奇宝贝的雕像。
另一个呢像是一只甲虫，这个雕像的两边着像是羽毛的东西，尾巴很短，尾巴上也有着像是羽毛的东西，不过这两个羽毛是朝上的。
仁拿出图鉴，图鉴上给出了资料是，太古羽虫和触手百合，不过这两种神奇宝贝都已经灭绝了，所以就没有更多的资料了。（抱歉，小狼是在是不会写描述一类的，抱歉。）
看到这里仁他们走到了太古羽虫旁边的那块石头，他们看着那块石头，石头上有着奇怪的花纹，仁准备吧石头拿起，仔细观看，可就在仁拿起石头的一瞬间，幻影之塔开始震动，天花板、墙上开始上开始掉落石头，很快就有刚开始的小石头变得越来越大。
看着这些石头仁他们知道这座塔竟然开始坍塌，就在这个时候第三层的墙上出现了一个窗口，说是窗口，但是这个窗口有一人多高，仁他们看着窗口出现抱着石头就往窗口跑去，然后顾不了这是在第三层，他们直接就跳了下去，好在下面是沙漠，他们平安的掉在地上。
小田卷博士他们呢也在幻影之塔开始坍塌的时候就抱着研究资料往外跑，刚出来塔就塌了。就在他们以为仁他们没有出来的时候，仁就在走到了他们的面前，看到仁他们没事，所有的研究员都松了一口气，他们开始整理这一次的资料，好在幻影之塔坍塌的时候已经调查的差不多了，所以损失也没有多大。
小田卷走到仁他们那里问道：“仁，你们是不是上到了第三层，那上面有什么？”
“是的，博士，那上面有。”：仁吧第三层的情况给小田卷说了，小田卷听后马上回过头看向那堆废墟，可是当他再次看到废墟的时候，废墟已经消失了。
小田卷遗憾的说道：“真是太可惜了。”
突然小田卷想起仁那里有着从上面带下来的那块石头，于是就找仁拿到了那块石头，小田卷看到石头的第一眼就认出了这是一块化石。
仁知道了这是一块化石后，就把化石交给了小田卷博士了。（上一章因为发的仓促，所以章节名和后面的剧情对不上，已经改了过来，抱歉。）
