这时于谦仍在山西、河南巡抚任上。他忧劳政务，对家庭照顾得很少。最让于谦愧疚的，就是对不住自己的妻子。巡抚晋豫十八年间，妻子董氏每年只有在他返京议事时才能见到他，欢聚的时日实在少之又少，更多的时日，董氏独自抚育着一对儿女。
正统元年（1436）于冕回杭州后，只有女儿璚英相伴，独自品尝着丈夫长年离家的孤寂以及对丈夫的思念与牵挂，为在太行山下或是中原大地上颠簸辛劳的丈夫祈祷着平安，守望着丈夫的归来。
千里之外的于谦每每想起辛劳的妻子总是心存愧疚，他有一首《寄内》诗表白了这种心境。
结发为夫妻，恩爱两相好。生男与育女，所期在偕老。我生叨国恩，显宦亦何早。班资忝亚卿，巡抚历边徼。自愧才力薄，无功答穹昊。勉力效驱驰，庶以赎天讨。汝居辇毂下，闺门自幽悄。大儿在故乡，地远音信杳。二女正娇痴，但索梨与枣。况复家清贫，生计日草草。汝惟内助勤，何曾事温饱。而我非不知，报主事非小。忠孝世所珍，贤良国之宝。尺书致殷勤，此意谅能表。岁寒松柏心，彼此永相保。
笔尖饱蘸着对妻子的炽热之情和刻骨之思，令人感动。然而于谦和董氏终究没有能够“彼此永相保”。正统十一年（1446），董氏不幸中年早逝。让于谦内疚的是：董氏上年秋天罹患“气疾”，想来当是今日所称的哮喘，病况严重，每次发作都要十余天。她曾经致信丈夫告知自己日益严重的病情，然而于谦则忙于赈灾安民、治理水患、在黄河岸边铸铁犀……他无暇顾及病痛中的妻子，只是在遥远的晋豫为妻子祈祷，希望妻子尽快痊愈。而且，在于谦想来，妻子的病并不重。但是上苍终究没有因为于谦的一片爱民之心而护佑他的亲人，缠绵病榻近一年的董氏终于等不及丈夫的归来，怀着对丈夫无限的思念和牵挂病逝于京城的寓所，在她人生的最后时刻，陪伴她的只有女儿璚英。
于谦没有能够回京为妻子送行，他让在杭州侍奉父母的于冕赴京将董氏灵柩运回杭州，安葬在于氏祖茔。
爱妻的早逝让于谦肝肠寸断。他写下了不少悼念爱妻的诗文。其中一首这样写道：
世缘情爱总成空，二十余年一梦中。疏广未能辞汉王，盂光先已弃梁鸿。灯昏罗幔通宵雨，花谢雕栏蓦地风。欲觅音容在何处？九原无路辨西东。
于谦的父母一直生活在杭州，而于谦自从步入仕途特别是巡抚晋豫后，就很少有机会回到故乡探望父母。父母年迈，于谦除了将儿子于冕留在他们身边就无以尽孝了。
正统十二年（1447），于谦接到他父亲的丧报，回乡料理丧事。
按礼制，父亲死，儿子应守制三年，但国家多事，正在用人之际，于谦奉调为兵部右侍郎，进京效命，不得尽丧礼。第二年，于谦母亲也去世了。这时明朝与瓦剌之间的冲突随时可能爆发。于谦再次被急调回京，担任兵部左侍郎，佐理部事，再次不得终丧。
国家的危难需要有力挽狂澜的英雄。多事的时局为于谦提供了一个一展雄才的舞台。
