1993年起第一轮承包合同陆续到期，为了进一步稳定和完善家庭承包经营制度，1993年11月15日，中共中央、国务院发出了《关于当前农业和农村经济发展的若干政策措施》，这个文件在强调以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制是农村的基本经营体制，要保持长期稳定的同时，对土地承包制度明确了五个方面的问题，第一，为了稳定土地承包关系，在原定耕地承包期到期后，再延长30年不变；第二，开垦荒地、营造林地、治沙改土等从事开发性生产的，承包期可以更长；第三，为避免承包耕地的频繁变动，防止耕地经营规模不断被细分，提倡在承包期内实行增人不增地，减人不减地的办法；第四，在坚持土地集体所有和不改变土地用途的前提下，经发包方同意，允许土地使用权依法有偿转让；第五，少数二、三产业比较发达，大部分劳动力转向非农产业并有稳定收入的地方，可以从实际出发，尊重农民的意愿，对承包地做必要的调整，实行适度规模经营。此后，1995年3月28日国务院批转了《农业部关于稳定和完善土地承包关系的意见》，1997年7月28日中共中央办公厅、国务院办公厅又发出了《关于进一步稳定和完善农村土地承包关系的通知》。在文件的指导下，各地开展了第二轮土地承包工作。截至2000年底，全国已有98%左右的村组完成了二轮土地承包工作，大多数地方按照中央的要求，将土地承包期延长到了30年。还有一些地方，根据自己当地的实际情况做出了比30年更长的期限规定。
1999年3月，《宪法修正案》第十五条明确规定：“农村集体经济组织实行家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制。”
2002年8月，《农村土地承包法》全面地对农民的土地承包经营权作了规定，并且对家庭承包经营的土地承包经营权，给予了充分的财产权利的保护。
三、国家对土地承包经营权的保护
1.国家对土地承包经营权的保护
（1）承包期内承包地的交回和收回。承包期内，发包方不得收回承包地。承包期内，承包方全家迁入小城镇落户的，应当按照承包方的意愿，保留其土地承包经营权或者允许其依法进行土地承包经营权流转。
承包期内，承包方全家迁入设区的市，转为非农业户口的，应当将承包的耕地和草地交回发包方。承包方不交回的，发包方可以收回承包的耕地和草地。
承包期内，承包方交回承包地或者发包方依法收回承包地时，承包方对其在承包地上投入而提高土地生产能力的，有权获得相应的补偿。
（2）承包期内承包地的调整。承包期内，发包方不得调整承包地。
承包期内，因自然灾害严重毁损承包地等特殊情形对个别农户之间承包的耕地和草地需要适当调整的，必须经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意，并报乡（镇）人民政府和县级人民政府农业等行政主管部门批准。承包合同中约定不得调整的，按照其约定。
（3）用于调整承包土地或者承包给新增人口的土地。
下列土地应当用于调整承包土地或者承包给新增人口：集体经济组织依法预留的机动地；通过依法开垦等方式增加的；承包方依法、自愿交回的。
承包期内，承包方可以自愿将承包地交回发包方。承包方自愿交回承包地的，应当提前半年以书面形式通知发包方。承包方在承包期内交回承包地的，在承包期内不得再要求承包土地。
（4）妇女婚姻关系变动对土地承包的影响。承包期内，妇女结婚，在新居住地未取得承包地的，发包方不得收回其原承包地；妇女离婚或者丧偶，仍在原居住地生活或者不在原居住地生活但在新居住地未取得承包地的，发包方不得收回其原承包地。
（5）承包收益和林地承包权的继承。承包人应得的承包收益，依照继承法的规定继承。林地承包的承包人死亡，其继承人可以在承包期内继续承包。
2.外出务工农民的土地承包经营权的保护对外出农民回乡务农，只要在土地二轮延包中获得了承包权，就必须将承包地还给原承包农户继续耕作。乡村组织已经将外出农民的承包地发包给别的农户耕作的，如果是短期合同，应当将承包收益支付给拥有土地承包权的农户，合同到期后，将土地还给原承包农户耕作。如果是长期合同，可以修订合同，将承包地及时还给原承包农户；或者在协商一致的基础上，通过给予或提高原承包农户补偿的方式解决。对外出农户中少数没有参加二轮延包、现在返乡要求承包土地的，要区别不同情况，民主协商，妥善处理。如果该农户的户口仍在农村，原则上应同意继续参加土地承包，有条件的应在机动地中调剂解决，没有机动地的，可通过土地流转等办法解决。
3.原土地承包经营权人返乡能否要回因撂荒而被集体收回的承包地《最高人民法院关于审理涉及农村土地承包纠纷案件适用法律问题的解释》第6条规定，对涉及发包方违法收回、调整承包地，或者承包方弃耕摞荒承包地的纠纷，按照不同情形，分别处理。发包方未将承包地另行发包，承包方请求返还承包地的，应予支持；发包方已将承包地另行发包给第三人，承包方以发包方和第三人为共同被告，请求确认其所签订的承包合同无效、返还承包地并赔偿损失的，应予支持。但属于承包方弃耕、摞荒情形的，对其赔偿损失的诉讼请求，不予支持。所称的第三人，请求受益方补偿其在承包地上的合理投入的，应予支持。
土地承包经营权人有权基于物权人的地位寻求法律保护，要求返还承包地。
四、土地承包经营权的流转
1.土地承包经营权流转的形式农村土地承包经营权流转的方式有转包、出租、互换、转让等。
（1）转包主要是指承包方把自己承包期内承包的土地，在一定期限内全部或部分转交给本集体经济组织内部的其他农户耕种。转包主要发生在农村集体经济组织内部农户之间。转包人是享有土地承包经营权的农户，受转包人是承受土地承包经营权转包的农户。转包人对土地承包经营权的产权不变，受转包人享有土地承包经营权使用的权利，获取承包土地的收益，并向转包人支付转包费。转包无需经发包人许可，但转包合同需向发包人备案。
（2）出租主要是农户将土地承包经营权租赁给本集体经济组织以外的人。出租人是享有土地承包经营权的农户，承租人是承租土地承包经营权的外村人。出租是一种外部的民事合同。承租人通过租赁合同取得土地承包经营权的承租权，并向出租的农户支付租金。农民出租土地承包经营权无需经发包人许可，但出租合同需向发包人备案。
（3）互换是农村集体经济组织内部的农户之间为方便耕种和各自需要，对各自的土地承包经营权的交换。互换是一种互易合同，互易后，互换的双方均取得对方的土地承包经营权，丧失自己的原土地承包经营权。双方农户达成互换合同后，还应与发包人变更原土地承包合同。土地承包经营权互换，是土地承包经营权人将自己的土地承包经营权交换给他人行使，自己行使从他人处换来的土地承包经营权。互换从表面上看是地块的交换，但从性质上看，是由交换承包的土地引起的权利本身的交换。权利交换后，原有的发包人与承包人的关系，变为发包人与互换后的承包人的关系，双方的权利义务同时做出相应的调整。互换土地承包经营权，是在同一集体经济组织内部，对人人有份的承包经营权进行的交换。该种交换改变了原有的权利分配，涉及承包义务的履行，因此，应当报发包人备案。
需要注意的是：第一，土地承包经营权互换只是土地承包经营权人的改变，不是原地块承包义务的改变，互换后的土地承包经营权人要履行互换后地块原来负担的义务。第二，互换土地承包经营权，要避免因此而打乱不同农民集体的土地权属。所以，承包人不能与其他集体经济组织的农户互换土地承包经营权。
（4）转让是指土地承包经营权人将其拥有的未到期的土地承包经营权以一定的方式和条件移转给他人的行为。土地承包经营权的受让对象可以是本集体经济组织的成员，也可以是本集体经济组织以外的农户。转让将使农户丧失对承包土地的使用权，因此对转让必须严格条件。在承包方有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源的，即可转让土地承包经营权。转让土地承包经营权的基础是农民有了切实的生活保障，否则不应转让土地承包经营权。转让的对象应当限于从事农业生产经营的农户。具备转让条件的农户将土地承包经营权转让给其他农户，应当经发包方同意，并与发包方变更原土地承包合同。
根据农村土地承包法的规定，转让土地承包经营权应当符合以下条件：
①转让人有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源。土地承包经营权是农民最基本的生活保障，因此，有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源的，才可以转让土地承包经营权。如何判断“有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源”，实践中可根据具体情况确定。比如已成为国家机关工作人员等。
②经发包人同意。转让土地承包经营权要经发包人同意，而不像转包、出租、互换只需向发包人备案。一是转让土地承包经营权，使得原有的承包关系终止，发包人与受让方要确定新的承包关系。尤其是将土地承包经营权向本集体组织以外的农户转让，发包人与受让方的关系也不再是集体经济组织与其成员的关系。同时还关系到受让方是否符合法律规定的主体资格，是否具有承包经营的能力。二是转让土地承包经营权，将使承包人失去土地承包经营权。如果由承包人随意转让，就可能出现某些人为了欠债还钱或者游手好闲将土地承包经营权转让。因此，转让土地承包经营权，经发包人同意是必要的。同时，对符合法律规定的条件转让的，发包人应当准许。
③受让方是从事农业生产经营的农户。一是受让方必须从事农业生产。从事工业、商业等生产经营的人不得成为土地承包经营权的受让方。二是受让方是农户。企业、城镇居民等非农户不能成为受让方。要求受让人是从事农业生产经营的农户，可以保证土地的农业生产用途，满足其他农户对土地这一生产资料的需求。
承包人转让的土地承包经营权，可以是全部也可以是部分。对于已经转让的，不论是全部转让还是部分转让，受让方都应与发包人确立新的承包关系。对于未转让的部分，原承包人与发包人应重新调整承包关系，变更原有的承包合同。
2.土地承包经营权流转的原则
（）平等协商、自愿、有偿，任何组织和个人不得强迫或者阻碍承包方进行土地承包经营权流转。
（2）不得改变土地所有权的性质和土地的农业用途。
（3）流转的期限不得超过承包期的剩余期限。
（4）受让方须有农业经营能力。
（）在同等条件下，本集体经济组织成员享有优先权。
3.土地承包经营权流转的主体土地承包经营权流转的主体是承包方。土地承包经营权流转必须建立在农户自愿的基础上，在承包期内，农户对承包的土地有自主的使用权、收益权和流转权，有权依法自主决定承包地是否流转和流转的方式。这是农民拥有长期而有保障的土地使用权的具体体现。任何组织和个人不得强迫农户流转土地，也不得阻碍农户依法流转土地。承包方有权自主决定土地承包经营权流转还是不流转，流转给谁，以及是采取转让方式流转还是采取转包、出租的方式流转。
4.土地承包经营权流转合同内容土地承包经营权采取转包、出租、互换、转让或者其他方式流转，当事人双方应当签订书面合同。采取转让方式流转的，应当经发包方同意；采取转包、出租、互换或者其他方式流转的，应当报发包方备案。
土地承包经营权流转合同一般包括以下条款：双方当事人的姓名、住所；流转土地的名称、坐落、面积、质量等级；流转的期限和起止日期；流转土地的用途；双方当事人的权利和义务；流转价款及支付方式；违约责任。
5.土地承包经营权流转效力的认定因土地承包经营权流转而引发的纠纷，审查土地承包经营权流转的效力，主要从以下几个方面进行：
（1）流转是否改变了土地所有权的性质和土地的农业用途。
（2）流转的期限是否超过了承包期的剩余期限，超过部分应属无效。
（3）受让方是否有农业经营能力。只要受让方不造成承包地长期闲置、荒芜，不进行破坏性、掠夺性经营即可，对于其受让后承包收益比之从前降低或明显减少则不应在审查范围之内。
（4）在同等条件下是否考虑了集体经济组织成员的优先权。
（5）是否办理了登记，未经登记的，不得对抗善意第三人。
6.土地承包经营权流转的登记土地承包经营权采取互换、转让方式流转，当事人要求登记的，应当向县级以上地方人民政府申请登记。未经登记，不得对抗善意第三人。
