话说，转眼就到了小兰比赛的日子，新一却接到了一个电话，一分钟后，新一就去找小兰：“小兰，我和琼还要处理一个案子，你放心，我们一定会及时回来的。”说完，拉着琼就离开了，却没有看到小兰失望的脸。
“话说，为什么这个案子来得那么巧，该不会是你不想看小兰比赛故意找的借口吧？”琼虽然知道剧情，但也要装一下的啦。“我是那种人么，刚刚目暮警官打电话来说有发生了命案。”
没多久，俩人就到了犯罪现场，死者是这栋房子的主人的朋友山崎先生，因为一场宴会来到这里，在察看一番后，两个人就已经确定了凶手。新一快速跑到大厅，要去揭穿这个凶手，琼就不一样了，悠哉悠哉地走，毫不在意。
“拜托，目暮警官，你到底要把我的客人扣留到什么时候啊？我可没那个时间陪你们做这种没有证据的调查。”坐在轮椅上的糟老头子对于目暮警官把他的客人扣留住很不满意。目暮警官则好言相劝，然后，工藤新一闪亮登场。
工藤新一指出犯罪过程后，琼进去也分析了其他问题，指出凶手就是——老爷，这栋房子的主人。老爷还在狡辩，新一直接把地球仪当球踢了出去，老爷急忙闪开，却证明了他的脚早就好了的事实，只好转头就跑，琼也要来炫炫球技，一球过去，正中后脑勺，老爷现场摔倒，然后被带上了警车。
一堆记者围了上来，琼不喜欢被记者围住，简单说了两句就把一切推给新一，自己离开，琼到小兰的赛场的时候，小兰已经开始败退，琼只好大喊：“小兰，新一到现在还在案发现场，你不应该给他点颜色看看吗！”听了这句话，小兰的怒气值蹭蹭蹭的上涨，几招秒掉对手，最终赢得比赛。不巧，新一刚好到了，于是工藤新一成功升级为工藤“沙袋”……
三天后，三个人去了多罗碧加尔乐园，没多久，小兰就被云霄飞车吸引了，琼不想去，新一就带着小兰去排队，而琼就静静看着工藤那个没情商的家伙和小兰一个女孩子讲福尔摩斯，琼心里暗叹：果然上帝是公平的，给你一个超纲的智商，就会把你的情商降为零，当然，我除外。这时，新一已经和小兰打起了赌，赌一个女生是体操运动员，完美答对。
终于目送新一和小兰上了云霄飞车，余光看见两个人——琴酒和伏特加。两个人就坐在云霄飞车的后面。云霄飞车启动，仅仅一会儿就回来了，刚一停下，就引起了一阵尖叫声。
琼眉头皱起：剧情终于开始了吗，也不知道我最终能不能灭掉那个组织呢。思考着，连命案现场也没有看。那边新一正在思考命案的凶手是谁，想了一会儿，就走到琼的旁边，询问琼的意见，而琼正在想未来怎样对付黑衣组织，没听见，好久琼才反应过来新一在叫他。“呐，想什么呢？这个命案有头绪了吗？该不会你什么都没想到吧？”新一觉得琼什么都没分析出来，瞬间开心起来，听了琼的话，就如同被一盆冷水浇在头上，琼只说了一句：“这个案子很简单，只是那两个穿黑色衣服的男的很可疑，虽然他们不是凶手，但他们绝对不是善茬。”新一也开始深思，突然目暮警官到了，看到沉迷于思考的二人，毫不客气地打断了二人的思考“琼、新一你们也在这啊！那这个案子就简单了。”旁边围观的人开始窃窃私语起来“他们就是那两个名侦探吗？好年轻的样子。”“当然年轻了，他们才是高中生，我女儿和她们一个学校的。”就连琴酒也看了新一和琼一眼，新一咳嗽示意了一下，全场静了下来。
“麻烦你们放开这位小姐，她不是凶手。”琼这句话刚一说出来，就引起了轩然大波，琼轻松地指出了真正的凶手，接着新一负责演示凶手的作案手法，琼负责解释所有人的问题，在凶手质问证据在哪儿的时候，新一淡定的拿出了证据——一串珍珠项链，绑着钩子的珍珠项链。琼也不甘示弱，解释了小瞳小姐脸上的泪痕朝向两边的原因，小瞳小姐就开始跪地痛哭。
一段时间后，琼和新一就明白了她杀死岸田先生的原因，因为岸田抛弃了她，所以她想在她与岸田第一次约会的地方用岸田送她的项链杀了岸田。小兰听了这个悲惨的故事，都已经感动哭了。
离开现场过后，琼和新一开始安慰小兰，却看到一个人影跑了过去，琼一眼就认出了这个人，是伏特加。琼看向新一，新一也看向琼，相互点了点头，琼就先去追伏特加，新一就和小兰说：“对不起啊，小兰，你先回去吧，我和琼还有点事情要做。”然后就去追琼，小兰也想追上去，鞋带却刚好开了，只能停下，心中却有一种预感，再也见不到新一的预感。
新一和琼躲在墙的后面，听着伏特加和某公司董事长的交易，琼却突然听见了脚步声，转身看见琴酒正挥舞着棍子朝新一砸去，琼帮新一挨了这一棍，静静地晕倒了，新一也听见了声响，急回头，却也被一棍子解决，交易完的伏特加注意到了琴酒，小跑过来，琴酒对伏特加有些不满意“竟然被这两个小鬼给跟踪了，可恶。”伏特加一脸淡定：“大哥，他们不就是那两个侦探吗，把他们杀了算了。”边说边掏手枪，琴酒拦住了他“等一下，警察还在这附近巡逻呢，我看就用这个好了。”从怀里拿出了一个盒子，“这是组织里面新开发的毒药，中了这种毒后，人死了，毒素却无法从尸体上检验出来，还没有人做过人体试验，就拿他们当试验品好了。”说着，开始向琼的嘴里塞药、灌水，动作一气呵成，然后是新一，还特喵的说了一句：“再见了，名侦探。”说完转身离开。没过多久，药效开始发作，琼只感觉骨头都要碎了一般，心里一直告诉自己：“没事，熬过去就行，再熬一会儿就好了。”果然，十分钟后，疼痛感没那么强了，但新一还是昏迷了。琼一站起来，就双腿有些发软，差点又摔倒在地上。
看着变小的自己和新一，琼无奈的准备把新一拖回去，就这样，忍受着满大街人异样的眼光，本来一个小孩子穿着大好几码的衣服，就已经很让人觉得奇怪了，关键是背上还背着同样奇怪的新一。费死了劲把新一带回家门口，琼却发现他够不到门锁，只好去找阿笠博士，这时，新一醒来了，看着琼，迷茫的问：“琼，你怎么变成这样了？”新一看着变小的琼，感觉有些好笑，“你先看看你自己吧，别光嘲笑我。”琼对这个损友彻底无奈。新一这才发现自己也变小了，一脸懵逼，琼大致和新一解释了一下变小的原因，新一却怀疑起来，琼只能把自己特勤局的身份说出来，还说了自己的任务。新一这才相信，琼更是把一切都说是由特勤的情报得来的，好在新一也没怀疑。两个人又去找博士，又解释了一大圈，两人换上新一小时候的衣服，这时，小兰因为担心新一，到了新一的家里，琼瞬间跑路了，而新一则跑到了书房里，博士要挡住他，新一却撞到了墙发出了声响，小兰过去看到新一竟然没认出来，新一也在情急之下说出了一个名字——江户川柯南。琼从暗处走出来，“这位姐姐，你能不能先放开柯南。”小兰一脸懵的看了一眼这个从拐角里走出来的小孩子，“你叫什么名字啊？”小兰问了琼的名字，琼早就想好自己的名字了，“慕容翼。”小兰听到这个名字有些好奇“呐，你和琼是什么关系？你们都姓慕容。”琼早就准备好说辞了“琼哥哥吗？我是他的弟弟，不过以前我都在美国，从他来到日本之后，我就很少见他了。”新一看着脸不红心不跳气不喘的琼，内心已崩溃，为什么我就想不到这样的说辞呢？阿笠博士在线将化名柯南的新一送给小兰，小兰很好奇，：“翼，你不用到我家吗？”琼解释道：“我们家族的孩子从小就接受独立训练，我在美国就是一个人住的，习惯了。”小兰也不说什么，带着柯南走了。
小兰走后，琼已经瘫倒在沙发上，“编故事什么的还真是累啊！”阿笠博士一脸无奈，和琼说：“你还好了啦，新一比你还惨，连准备的时间都没有，要不然过两天，我送你去米花小学上学吧，毕竟一个孩子不去上学，难免会引起别人的注意。”琼对上学倒也不介意，反正新一也要去“没问题。”
回到家，琼和家人打了个电话，说明了自己的情况，打算过两天先回国一趟，办一下这个身份的身份证，并汇报一下任务情况。又出去买了几件衣服，才收拾收拾准备睡觉。
