于是女娲娘娘便取消了对龙族的命令，四海龙王理所当然收回了大军，可是未曾想到这中间出了大变故。
以敖广为首的四海龙王并不知晓五十万水军全军覆没，而应龙前阵子还回龙族招来他的心腹手下一万多兵马离开龙族，说是要好好练兵。起初龙王们并不在意，可是当女娲颁下撤退旨意之后他们终于发现了问题，龙族水军竟然使唤不动，再一探访之下又发现，龙族不仅全军覆没，而且应龙的一干手下竟然宣示脱离龙族，加入人族有熊。
好家伙，一上来就折腾光人家的五十万大军，还暗地里挖人家的墙角，如今龙族不仅出了叛逆，还元气大伤，翘不起尾巴了。
敖广愤怒之下带着其余三兄弟前去质问轩辕，没曾想轩辕推脱掉开来，竟说人族广纳天下贤才，此事纯属应龙将军他们个人意愿。轩辕还说当初敖广答应提供军队，又没说不能够将龙族水军收入囊中。反正理由一大堆，而且什么事都与他毫不相干。
敖广一听当场就要发飙。
这轩辕说的义正言辞，道理完全站在他一边，好像自己有多么无辜，受到多大的委屈。想到这事是当初自己搞得，如今竟弄成这样，隐忍功夫一向到家的敖广撕下他身上的面具，立刻露出獠牙。可惜，敖广怒急攻心，失去理智，但旁边三位龙王可是明白人，他们立刻阻止敖广。
人族大兴乃是天道大势，轩辕又为天定人皇，其人皇之位乃由圣人确立，四海龙族不能与他们闹翻，免得得罪了在场的阐教诸仙，还得罪了大教背后的圣人。同时他们也不敢对应龙他们这些叛徒进行追捕，以免弄僵双方关系。
于是龙族打落牙齿咽血吞，和平友好的解决了此事。而此事传播出去以后，龙族顿时成为洪荒笑柄，实在是没想到一向强悍的龙族竟然阴沟里翻船，在人族手中吃了大亏还要赔不是。不过轩辕也没有做绝了，打他以后，人族大地上的水域便有龙族负责，而且人族信奉龙族，以龙作为他们的最高图腾。龙族虽说元气大损，但有了人族的供奉，再加上四海之地，那真的是气运长存，连绵不绝，说起来还是他们占了便宜。
而轩辕解决了龙族事情之后，又根据玄女的指点，令人族能人巧匠制造指南车，此车用来指定方向，不虞人族军队在九阴神煞阵中迷失方向。
轩辕经过玄女的多次指导之后，深深地被九天玄女那惊人的才华与气质气吸引，九天玄女则利用轩辕的好感大肆在人族中传播天庭的存在，让人族感受天庭的威严，因此天庭声名远播，人族终于有人开始供奉天庭诸神。尤其是不少人在九天玄女的宣扬之中竟认为天庭乃是天下正统，玉皇大帝乃是洪荒至高无上的存在。
至到此时广成子方才清醒过来，明白自己犯下了大错，不但让九天玄女插手人族事务，还让天庭入主人族，在人族传播开来，可是现在他想阻止也为时已晚，人族已有少数人开始对天庭产生了好感。
就在广成子不知该如何是好的时候，玄都大法师奉老子之命下凡，赐于轩辕后天功德至宝‘轩辕剑’，此剑是以首山铜合功德玄黄之气所铸，可镇压人族气运。
与玄都大法师同来的还有阐教的南极仙翁，云中子，他们身上带着老子所赐九转金丹，能够完全恢复十二金仙的伤势，而南极仙翁，云中子他们也奉诏待在人族相助人皇，这可是把整个阐教精英给抽出来支援轩辕了。
这三人在下界之时元始天尊让他们传话于广成子，小心防备九天玄女，尽早结束与蚩尤的争斗。同时要尽量压制天庭的活动，将蚩尤之事交给天庭处理。
那天庭既然插手了人皇之争，那么就不能白得好处，怎么也要出一点力。九天玄女不是想用夔牛兽鼓与周天星斗之力来破阵吗？那正好成功了阐教可以顺利地解决蚩尤，而巫族的怒火也会转移到天庭之上，不成功那么这主意是你九天玄女所出，后果自然由你负责。
广成子在得到元始天尊的提示后，心情十分的复杂，正是因为自己等人的无知，才使得人皇轩辕一步步走入了天庭的阴谋之中，现在他虽然也想提醒轩辕不要轻易相信九天玄女，可是已为时太晚，轩辕已经被九天玄女给迷惑住。
天庭之上玉皇大帝与西王母见九天玄女如此容易就得到了人皇轩辕的信任，也是十分的高兴，天庭终于在人族中有了一定的地位，虽然还比不了圣人但这也是一个不错的开始。于是他们又决定加大对轩辕支持的力度，还琢磨着是不是要派兵下凡助他一臂之力。
广成子明白如果不快点结束人皇之争，那么随着九天玄女的宣传天庭的名字将会深入人心，这对日后他们传教会造成不必要的麻烦。
广成子在与阐教诸仙商量之后，便开始鼓动轩辕早日出兵平定蚩尤及他的九黎部落，也好早日让九天玄女离开人族。
九天玄女是个聪明之人，在见到阐教诸仙的这一举动后立即明白对方看穿了自己的意图，如果不是顾及轩辕恐怕自己难逃阐教诸仙的毒手，如今她已经完成了玉皇大帝的旨意，所以并不想与阐教诸仙发生冲突，也顺水推舟鼓动轩辕早日出兵平定蚩尤，阐教诸仙见九天玄女如此知趣也放心了许多。
于是没过多久轩辕有领军出征，再一次向蚩尤发动进攻，地点还是逐鹿。不过轩辕这次顾及伤亡，并没有多派人手，只有二十万军队，与往日相比不可同日而语。
另一方面，相比人族受打击能力的强大，九黎部落可是举族哀愁。
没想到以前屡战屡败的人族这次竟然将九黎大军给打得七零八落。虽然最后还是九黎取胜，但九黎可不比中原地带，人口众多，他们地处偏荒，再加上远离后方，士兵是死一个少一个。想到这轩辕就像打不死的小强，这才过了多久就又来了，九黎一族的士气第一次陷入低谷。
蚩尤也很明白自己的处境，尤其是曝露出最后的底牌九阴神煞阵之后没有取胜，那时他就知道自己没有翻盘的机会。轩辕一方有这么多能人，他的九阴神煞阵挡得过一时，但是挡不过一世，
“该到结束的时候了！”蚩尤感慨一声，想起数年征战，如今该是有个结局，只是轩辕想这么容易就赢了自己，痴心妄想，蚩尤不由得握紧拳头，坚定的回到大帐之中，招来众人商量。
最后，九黎大部分人暗地里由九凤领头悄悄遣走。
这大战愈演愈烈，人力已经是无法对抗，再多的人最后也只能给大地增加点养分。而九凤此人心思细腻，处事有方，有她接掌九黎大权，以后轩辕就算想要彻底剿灭九黎是极为困难的。
安排好后事之后，蚩尤身边还有大巫风伯雨师相柳、八十一巫人长老以及三千精兵。本来蚩尤也想把他们全部劝走，但他们谁都不愿堕了巫族声威，愿陪着蚩尤一起战死。
蚩尤也不勉强，带着这些兄弟等待这场暴风雨的来临！！！
当轩辕来到这里时，整个逐鹿平原都已经乌烟瘴气，大雾迷天，阵内群魔乱舞，鬼哭狼嚎，隐隐间出现若干魔火血云，又在众人的注视下悄然不见。天地之间的魔气缓缓凝聚于此，而又渐渐的被九阴神煞阵所吞噬而去。
饶是众仙见多识广，看到这可怕的场面也是毛骨悚然。这种阵法，对于他们这些涉世未深的仙人来说简直是前所未闻。
身为阐教击钟第一金仙，可谓是一人之下万人之上。
眼见这个场中修为最高的家伙不识抬举，像个木头人呆站在那儿，仿佛是与他毫无关系。要知道阐教已经是颜面大失，这次再不胜利，连十二金仙都没法见人了。想到这里，广成子更加气愤。
场外，轩辕已经连续叫喊数次亦不见人回应，这更令大家心中莫名不安。虽说准备充足，但并没有十足把握，不过就算心中胆怯也要硬着头皮冲，于是最后众人成群结队的进了大阵。
阵外，在轩辕众人进去之后便已发生变化，庞大无比的大阵迅速压缩，邪气萦绕，一道魔光直冲九霄，将漫天星辰给遮住了。
广成子他们并没有察觉到阵外的变化。在指南车的带领之下，人族大军和群仙沿着一路上畅通无阻，即使幻象重生，但阵外由夔牛兽之皮做成的大鼓咚咚作响，大家受此刺激并没有迷失心性。
大军停停走走，一步一步小心翼翼的向前迈去，好半天，终于来到中间一祭台之处。这祭台也无何出众之处，但血腥味凝重，魔气散布，一健硕裸身的男子站在上面，眼中血光密布，满身触目伤痕。地下，一把大刀时不时的出现白虎呼啸之声。不错，正是蚩尤一人。
“蚩尤，你恶贯满盈，今天就是你的死期。”轩辕见蚩尤现身，拔出老子所赐之轩辕剑，一股玄黄功德气从中透体而出，顿时将周围的魔气冲得一干二净，整个祭台一时明亮了起来。
“你来了！”蚩尤好似十分疲惫，接着双目一睁，狂声叫道：“轩辕，这次我要与你做个了断。”
“哼，此次有这么多前辈高人在，你是在劫难逃，还是赶紧束手就擒，以免多造杀孽，也许本皇饶你不死。”
“哈哈哈，你除了狗仗人势，以多欺少之外还有何本事，竟要我投降？我告诉你，只有战死的巫，没有投降的巫，来吧，让我们痛痛快快的决一死战。”说完，蚩尤将地上魔刀拔地而出，一声怒吼，魔刀瞬间涨大无数，再一个横劈，轩辕一方不少人被斩成两截。
随着蚩尤的动手，周围的环境突然间大变。
一大群数也数不尽的恶魂野鬼扑向轩辕大军所在，他们用尽各种手段折磨人族，以他们血肉为食，吞噬他们的魂魄。可怜的人族何曾见过这种情景，绝大多数人被吓得丧失心智，即使有个别坚强的人挣扎着，但他们的武器对魂魄起不了作用，刀砍在鬼魂的身上就好像砍在空气一样，一点事都没有。
九天玄女见状，拿出玉帝所赐灵宝‘兵符’，一股仙灵之气覆盖住人族军队，接着散发出夺目之光，所有的鬼魂一个个消融在灵光之中。
突然，局势再变。消散的魂魄没有化作虚无，反而在灵光的笼罩之下变成一道道烟雾云气，又冲向人族所在。“兵符”所散发的灵光对这股烟雾不起作用，直接被透射而过。
九天玄女见此大惊，不知此烟雾乃是何物，竟然能够穿透而入。好在这股烟雾并没有造成直接伤害，只是被它缠绕上的人会变得浑浑噩噩，斗志全消。
这时，情况再变。一队队九黎战士三五结群的借着从地下遁出，又隐入了了烟雾之中，人族之中屡屡传出痛苦悲呼之声。那九黎战士兵器上淬毒，只要被割伤了就会伤口化脓，逐渐向全身腐烂，除非能够当机立断割去伤口，不然只能眼睁睁的死去。
九天玄女无奈，只得取出兵书，一句句箴言从中透出，人族大军似乎有了指引，慢慢的围着八卦阵势旋转，中间有应龙手下一万水军做支援，依太极之势护成犄角，终于挡住了这层出不穷的灾劫。
做完这些，眼见人族稳定了阵势，而九黎一方又消停下来了，玄女终于放松下来。不料，正在这时旁边传来一声“小心”一条黑蛇直扑而来，大意之下的玄女根本做不出反应，就在这千钧一发的时刻，轩辕黄帝现身将此蛇斩杀，救了玄女一命。
轩辕自开战以来，众仙怕他有个损伤造成不可挽回的大错，于是只是让他站在后面支援，其实是作壁上观。见玄女有难，轩辕终于出手了，黑蛇在他的一剑之下直接蒸发，化作一道道毒气。不愧是太清圣人老子亲手所造之兵器，当真是非同凡响。
不过异象再起，大巫相柳这时出现在两人上空，无数毒液冲他们而去，下方，正是人族大军所在。
不得已，轩辕玄女两人只得打起精神硬碰硬的跟相柳对战，好在有老子所赐轩辕剑在，相柳亦不敢过分相逼。
另一方面，相比人族大军的险象环生，这蚩尤与十二金仙一战却是有些沉闷。双方已经交过两次手，有什么手段早已了解透彻。只是这次不同，十二金仙有了老子九转金丹相助之后，不仅伤势痊愈，甚至隐隐有突破的迹象，其中广成子已经踏入了大罗金仙嵚峰的行列，再加上十二金仙配合默契，又有心拖延，只是游斗而已，所以蚩尤就是想要得胜也极不容易，只能凭着一股蛮力消耗双方法力。
巫族大巫的实力是毋庸质疑的，而且还是两个大巫一起上阵，即使是准圣也吃不消，更何况这两个大巫身经百战，一身战斗经验无与伦比。
突然，从九天之上降下一金甲神人，领着数万天兵天将从天而降，他们闯入阵中，将九黎大军挡住厮杀，那神人转首对黄帝说道:“小将奉昊天金阀无上至尊自然妙有弥罗至真玉皇上帝(又名高天上圣大慈仁者玉皇大天尊玄穹高上帝)之命前来相助人皇。
说完便领着一众天兵天将向巫族杀去，黄帝麾下众将士见天帝派兵相助自己一方顿时士气大振，而蚩尤一方却是心存死志，见连天兵天将都来了，再也没有获胜希望，于是以命换命，更加奋勇杀敌，一时把轩辕一方的大好形势给打没了。
轩辕也没想到这来了援兵之后敌方不见没有士气低迷，反而是暴涨起来，更为疯狂。
