收服了哥达鸭的小茂来到果实七岛，买了很多当地特产文旦，分别寄回研究所以及成都地区的小雪，然后就开始了自己的休闲之旅。
此时小茂身上的精灵分别是水箭龟、化石翼龙、勇吉拉、哥达鸭、墨海马、电击魔兽六只精灵。小茂在收服哥达鸭之后最终还是将水土不服的鸭嘴宝宝换成了可以克制水系精灵的电击魔兽。
这一天，小茂在橘子群岛的一座无人岛上休息，这座岛名叫美女橘岛，位于橘子群岛的东北部，这座岛屿的大部分都被森林覆盖，四周的悬崖下都是海滩，这是一座未被开发的天然岛屿，所以很受当地人的喜欢，此时的海滩上热闹非凡。
快正午时分，原本还阳光和煦的天空中，美女橘岛的正西方向风云突变，滚滚黑云汹涌而来，明亮的天空突然的昏暗了下来，倾盆大雨瞬间落在了沙滩之上，整个沙滩混乱一片，小茂从躺椅上站起，看着西方海面，勇吉拉自觉地竖起能量罩帮小茂挡住大雨侵袭。
没过一会，大雨骤停，大片的雪花从高空中飘落下来。
小茂将手伸出能量罩外，感受到雪花的温度，自语道：“奇怪，这是夏天，怎么会下雪，而且橘子群岛也没有下雪的前兆啊。”
话落，雪花散去，头顶上的乌云快速的消散，阳光再次透射下来，美女橘岛的森林中却混乱一片，波波、列雀等等全都从树林中飞了出来，向着西方飞去。
小茂极目眺望，发现不止是陆地，海平面也一样，橘子群岛海域的神奇宝贝神奇宝贝全都以亚西亚岛为目标而开始移动，能游泳的神奇宝贝在大海中移动，会飞的神奇宝贝全都跨海域飞行，而无法游泳的神奇宝贝全都移动到距离亚西亚岛最近的岸边。
“这是什么情况？西边发生了什么？”小茂想着，然后迅速的从身边的背包中拿出一张地图，美女橘岛的正西偏南方向有一座岛屿——亚西亚岛。
这座小岛在地图上显示就像是一个猫爪一样，三个卫星小岛拱卫着它，小茂看到这座岛屿还没有多想，但是这三个卫星小岛的名字引起了小茂的注意，分别是火之岛、雷之岛、冰之岛。
“难道是这里出了问题？谁会这么有胆量去挑战这三个家伙啊，它们虽然不是一级神，但是也是拥有神位的二级神，不是随便什么人都可以去挑衅的啊。”小茂仔细的想着。
火焰鸟、闪电鸟、急冻鸟这三只神奇宝贝，是神兽的一种，属于二级神，掌管着关东地区火雷冰三种属性的神兽，这三只神奇宝贝在整个精灵世界有很多，但是拥有神位的只有在亚西亚岛附近三岛上生活的这三只神奇宝贝，只有有神位的神奇宝贝出事才会发生天气异象，不然当时在无人发电厂抓闪电鸟的时候就该出现意象的。
“不好，可能出事了！”小茂越想越觉得不对，事情来的太过突然，来不及细想，小茂拿起地上的背包，然后甩出水箭龟的精灵球，跳上它的后背，指挥着向着亚西亚岛游去。
此时的亚西亚岛正是一片混乱，天空中一只天蓝色的鸟神奇宝贝在肆意的喷吐着急冻光线，将整个亚西亚岛海域全都冰封，迫使小茂不得不换成化石翼龙来飞向亚西亚岛。
当小茂来到亚西亚岛之后，海面上空又变成了另一个场景，三神鸟在空中混战，好不激烈，整个天空雷电、火焰、寒冰漫天乱飞，亚西亚岛的居民都遭了殃，虽然不是三神鸟有意如此，但是还是有很多的居民在这种无意状态下丧生。
火焰鸟
等级：95级
性别：无
属性：火+飞
特性：压迫感
携带物：无
资质：神兽
闪电鸟
等级：95级
性别：无
属性：电+飞
特性：压迫感
携带物：无
资质：神兽
急冻鸟
等级：95级
性别：无
属性：冰+飞
特性：压迫感
携带物：无
资质：神兽
小茂看的是心惊胆寒，神兽之间的战斗，根本不会如此和谐，这是一种神位力量的争夺，坐在化石翼龙身上的小茂很快便发现亚西亚岛海岸边的小智等人，立刻指挥化石翼龙飞了过去。
“发生了什么事？”刚落地的小茂立刻问道：“你怎么也在这里？”
“呃，你是？”芙芦拉不认识小茂，看到这么一个训练家骑着一头化石翼龙出现，还是有点戒备的问道。
“我是真新镇的小茂，跟他是从一个地方出来的。”小茂指了指旁边的小智说道。
“我是乘船遇到风暴，然后被吹到这里的。”小智说道。
“哦，原来你是小智的朋友啊，你好，我是这里的村民，我叫芙芦拉。”芙芦拉得知小智认识对方，就放下了戒心。
“你好，请问，这么究竟发生了什么事，现在整个橘子群岛都混乱不堪。”小茂问道。
“这个说来话长了，看那边！”小智说道：“就是那个东西，抓住了闪电鸟跟火焰鸟，我们将它们救出来之后就变成这样了。”
“你是在逗我么？就这么一个空中飞船能够抓住闪电鸟跟火焰鸟？它俩可是有神位在身的，怎么会被科技的力量所慑服？”小茂一脸的不可思议，确实如此，神位在身的神兽所拥有的力量不是随便什么高科技可以抗衡的，就现在天空中这火、雷、冰三种逸散的能力就不是人力所能对付的，更何况是完整状态下的三神鸟。
其实吉尔露太抓捕火焰鸟跟闪电鸟的时候，一个是这两只神鸟完全是轻敌，另一个是刚刚从沉睡中醒过来，身体的力量还没有完全觉醒，然后被特殊手段限制力量，不然凭借吉尔露太的这个空中堡垒根本无法对方三神鸟，抓个没有神位的三神鸟或许还有可能。
“是真的，不知道是什么原因！”小智也不知道怎么解释。
“火之神、雷之神、冰之神、是神圣不可侵犯的，否则会引起天地震怒，世界走上毁灭之路，这是我们这里的传说。”芙芦拉说道。
“三神鸟而已，还不至于毁灭世界，但是毁灭整个橘子群岛海域还是有可能的。”小茂不屑地说道，如果是上一世的小茂或许就信了，但是这一世小茂脑海中可有存有更厉害的神兽的资料，哪一个不是有毁天灭地的能力，仅仅三神鸟还不至于毁灭世界：“亚西亚岛有个传说，据说火之神、雷之神、冰之神都居住在那里，如果一科学的方法来分析，被称之为冰之神的某种力量让海面冻结的话，被称为火之神的某种生命就来融化冰块，这是在海底深处诞生海流的原因，被搅动的海水中，雷之神的能量又产生来作用，在海流中产生蛋白质，从而产生橘子群岛附近海域的生命根源，三种神明的力量均衡的互相作用，身深层的海流和缓的流动而创造出这片海域中的生命，深层海流的中心地就是生命的诞生之地。这是我在一本书上看到的，现如今出现这种现象应该就是之前这个飞行堡垒抓住了火雷二神鸟而导致三种力量失去原有的平衡，但是现在这种情况，三神鸟明显都处于愤怒状态，互相在争夺地盘而大打出手，这可没有办法啊！”
就在众人议论的时候，一股庞大的水龙卷从冰层深处喷涌而出，攻击到正在激斗的三神鸟，水龙卷逐渐散去，一只白色的挥舞着巨翼的神奇宝贝出现在三神鸟中间。
“海之神，洛奇亚！”呆呆王呆呆的说道。
洛奇亚
等级：95级
性别：无
属性：超+飞
特性：压迫感
携带物：无
资质：神兽
小茂看着这只洛奇亚的资料，发现并没有想象中的那么厉害，至少没有见过的凤王那样，各种资料全是“？？？”，这让小茂很怪异，掌管着整个关东地区海洋的神兽等级才95级，这有点不可思议。其实主要是这只洛奇亚的年龄也不是很大，刚刚继承海之神的神位没有多久，再加上在海底沉睡世界日久，所以小茂才能看到它的资料，如果再等一段时间，估计也会是“？？？”。
洛奇亚的行为更加激怒了三神鸟，三神鸟竟然放下暂时的恩怨同时向着洛奇亚发起攻击，大威力的闪电、火焰、寒冰向着洛奇亚攻去，洛奇亚狼狈的闪躲着，冰层被雷电打碎，再次被寒冰覆盖，又被火焰融化，来来回回的变化着它的形态，同时也告诉现场的众人，这是多么庞大的力量。
“海之神，为了拯救世界的毁灭而出现，但是还是无法让世界免于毁灭。”芙芦拉自言自语的说道。
“伤脑筋！”呆呆王说道。
说着，三神鸟的攻击全部都命中空中的洛奇亚，洛奇亚奋力撑起念力护盾，抵挡着来自不同方向的攻击，但是护盾终究是没能坚持太久，三种能力全威力命中洛奇亚，洛奇亚砸碎冰层跌落海中。
“要怎么办才能制止他们啊？”小智急切地问道。
“只有优秀的控制者才能平息三神鸟的愤怒。”呆呆王一脸无奈的说道。
“那谁是优秀的控制者呢？”芙芦拉问道。
呆呆王听到后转向小智，说道：“就是得到两种宝藏的人。”
“你是说优秀的控制者会拯救整个世界？”芙芦拉问道。
“你该不会说那个人就是小智吧！”小霞一脸惊讶地问道。
“现在，也只有这一个解释了。”小建在一边说道。
“我？你们说是我？”小智一脸不可思议的表情，然后指了指自己，在快速的后退说道：“我？我是想成为神奇宝贝大师，但是我不觉得我能够拯救世界。”
“但是目前符合传说中的条件的人只有你了。”小建说道。
