不只是法国公开挑战了美国的中立政策，大不列颠内阁的一些不明智做法也把美国的这一政策推向了崩溃的边缘。因为农业歉收，法国出现了十分严重的粮荒。此时，大不列颠决定利用海军的优势，截断法国的所有海上供应。1793年，英内阁指示扣留所有开往法国的商船，强迫商人卸下货物，然后进行并购收买，并补贴给他们一定的运费。大不列颠的这一行为引起了美国各界的愤慨，美国政府为此向大不列颠提出了强烈的抗议，警告说这样做的话便是违反了中立国的法律，并且还践踏了人道主义精神。
面对美国的指责，大不列颠政府一意孤行，并且还扣留了美国海员为他们服务，由于美国人和大不列颠人同族同类，因此最容易遭遇英国军队的绑架。大不列颠拒不归还大湖区一带的碉堡的行为，进一步激发了美利坚合众国的反英情绪。直到此时，华盛顿还仍旧感觉不能随便采用武力，但国会内部有很多人都认为应当对大不列颠强硬一些。国内激进的亲法派基本上不考虑本国的条件，强烈要求马上使用武力夺回大湖区一带的碉堡。但是华盛顿却坚持认为不行，即使动手的理由很充分，也要首先摆平对法国和大不列颠的关系，否则一旦战争爆发，后果将会不堪设想。在俄亥俄地区，受到英国军队挑拨的印第安人也在不断进行着叛乱。由于他们拒绝进行谈判，韦恩的队伍再次转入了进攻。
1794年，新一届国会开幕了，会上有很多棘手的事情需要进行决定。热内的阴谋加上大不列颠的鼓动，令战争的阴云再次飘到了美国的上空。华盛顿首先在开幕词中对人民让他再度当选为总统表示了感激。接着他说，面对欧洲的战争，美国应当采取的办法是与各国保持和平友好的关系，只有这样，才能确保美国的利益不会受到损害。他向国会强调必须要加强国防力量，否则美国在他人的眼中只会是一个弱国。美国需要和平，但是和平却不能依靠他人来给予，它需要依靠强大的武力做保障。因此，华盛顿极力主张要采用扩军备战的办法。在他的讲演当中，华盛顿再次向议员们发出了忠告：当务之急便是要加紧偿还所欠的国债，节省出宝贵的时间来发展经济。依据众议院的要求，2月23日，杰斐逊提交了一个美国和其他各国贸易往来的统计表。美国进出口商品的种类和范围在这份表格中都可以令人一目了然。杰斐逊特别说明，当前美国的商品出口存在着好多的困难，因此他建议通过制定抵消关税法和友好协商的方式，来为美国商品营造出安全、和平的出口环境。为了保障公民们的商贸以及海上交通的权利，杰斐逊建议国会尽快制定出有关这方面的法规。
美国当时的政局十分复杂，欧洲的态势也充满了变数。法国王后已经被处决了，杀人如麻的雅各宾派一直都没有停手。美国在内部开始出现不和谐因素，美国军队不只要防备来自于欧洲的危险，还要对北非沿海的海盗进行打击。形势十分糟糕，这些事情全部都压在了总统的身上。华盛顿全心全意地寻找着冲出困境的正确途径。他对世界各国出现的事情基本都了然于心，一些反对联邦群体的行动也没有逃脱出华盛顿的眼睛，当前他们使用的唯一方法就是不停地诽谤华盛顿。
杰斐逊的商务报告很快便通过了众院的审议，同时，麦迪逊还提出了一些有关于加强美国商人在海上安全的议案，议员们在审议这些议案时争吵得十分厉害，甚至有人出言不逊。华盛顿认为，以上问题并不只是商业问题，它还涉及到亲法派和亲英派之间的派别之争，这就无法避免地和政治拉上了关系。在全部的辩论过程当中，部分议员甚至还建议，应当在某些议案本子上面盖上“亲法”和“亲英”的印记，以便让大家明白谁是亲法派，谁是亲英派。此次辩论持续的时间超过了半个月，从1月13日开始一直到2月3日才结束。在进行表决的时候，第一项议案以5票的微弱优势得以通过。其他那些议案却是一拖再拖，直到三月底也没有得出结果，最后不了了之了。
3月27日，有人建议将所欠大不列颠的债务扣下来，留作自己的国库基金进行使用；不但这样，美国还应当向大不列颠政府抗议，责令他们赔偿美国商船的损失。英国军队的残暴行为激起了美利坚合众国人民的极大愤慨，各州都有群众进行集会，要求严惩大不列颠的肇事者。现在，亲法派占了上风，很多人都感觉，假如在此情形下美国人仍和大不列颠保持友好的话，那么简直就是太懦弱了。为了表明他们的反英决心，很多人还联合成立了民主公社。在这一关键的时刻，美国驻英公使送来了消息说、大不列颠已经撤销了过去制定的法规，严令大不列颠各舰释放被扣押的美国商船。同时，大不列颠政府还发表了声明，承认他们在对待商船的做法中有过激行为，因此特向美国人民道歉。4月4日，美国国会就大不列颠做出的新承诺开始了辩论。联邦党人认为大不列颠为美国解除了忧难，因此，他们不同意美国政府采用强硬办法；反联邦党人现在也不再像过去那样激进，他们同意观察一下事情的发展情况，然后再做决定。杰斐逊尽管是一位亲法派，可他强烈要求美国不要卷入战争，最好是通过和平谈判的方式来解决所有的纠纷。
当时美国的部分地区已经出现了叛乱，要想将叛乱平息，需要动员7000名士兵，假如任由叛军势力蔓延，局势就一定会变得更加严重。8月7日，华盛顿发出了公告，责令那些反叛者马上解散，假如在9月1日前仍旧不能解散的话，政府就要采用强硬的手段。同时，华盛顿还指示宾夕法尼亚州、新泽西州、弗吉尼亚州和马里兰州各派一支队伍组成一支讨伐大军。没过多久，这支队伍的总人数就已经达到了1．5万人。华盛顿认为，如果不及早铲除此次叛乱的话，就一定会酿成十分严重的后果。这些叛乱社团大多都由一些心术不正的人建立，他们首先打算毁灭的是人民对政府的信任，将人民不满政府的种子播撒出去。假如让这些种子开花结果的话，美国将无法继续进行经济建设。
反叛者拒不解散，华盛顿于9月5日再次发布了警告，声明政府将要采取强有力的手段，来对这些冥顽不化的反叛者进行讨伐。很快，华盛顿就亲率大军前往宾州西部镇压叛乱了。就当要离别费城的时候，华盛顿接到了摩根少将的来信，在信里，摩根说自己正带领着一支弗吉尼亚民兵行进在讨伐叛徒的路上，李将军是这支队伍的总指挥。华盛顿对他的行为深表感谢，同时他和摩根约定在坎伯兰要塞地区进行会面。队伍集合完毕后，华盛顿到了贝德福德，在这里他接到了通知，然后便返回了费城参加了第三次国会。
国会于11月9日开幕，华盛顿在国会上发表了演讲。谈到宾夕法尼亚州边陲出现的叛乱时，华盛顿强烈地谴责了事件的幕后 “挑动者”。在讲述了这场暴乱的因果之后，华盛顿说：“出现了这样的事情，我感觉到十分遗憾。是一些人的野心导致很多人丧失了做人的权力。实践证明，现在美国的繁荣昌盛已具备了很好的基础，人民充分了解到了自由和民主的真正含义。即便是有人搞阴谋诡计，但聪明英勇的我国人民一定会将这些人的阴谋粉碎掉的。正如捍卫我们的权利不受侵害一样，美利坚合众国绝对不会允许有人对法律进行践踏。华盛顿又说，“很多反叛者被眼前一时的利益所迷惑，当他冷静下来之后，则必然会为个人的行为感觉到惭愧。追求自由和正义的美国人正在用双手建设自己幸福的家园，假如《美利坚合众国宪法》被推翻的话，那么全部美洲大陆将会再次陷入到痛苦的深渊当中。”华盛顿对那些居心叵测的人的指责，让大家看到了他的勇气和魄力。
