罗斯福的威望与日俱增，绝大多数美国人支持他。这次竞选中他以27 243 466票获胜。美国民主党人不顾连任三期的争议问题团结一致爱戴他，对他的胜利发挥了重要作用。然而，归根结底，他获胜是因为美国人民在面临严重危险的国际形势下，要求他担任危机时期的领袖。
对于美国人对谁寄予同情，这本是毋庸置疑的事。在回答盖洛普民意测验的人当中，有82%的人希望盟国赢得胜利；只有2%的人赞同纳粹德国。但是，美国人深恐再度被拖进一场欧洲战争。9月3日晚上，总统在向全国发表一次炉边谈话时说：“我希望美国不介入这场战争。我敢向你们保证，你们的政府要为实现这一目的作出应有的贡献。只要我有权在握，和平决不会在美国覆灭。”为防止战火蔓延到大西洋彼岸，他在美洲国家周围画了一个离海岸300英里的防御圈，并发表了一项中立宣言。同伍德罗·威尔逊1914年的做法有所不同，他没有要求美国人在思想上保守中立。总统接着说：“甚至一个中立者也有权考虑事实。甚至也不宜硬要中立者不去思维，或者失去他自己的良心。”
总统在起草即将向国会两院联席会议发表的讲话时比平常更小心谨慎。在头天下午，他在白宫召见了两党的15位国会领袖，藉以讨论这项法案。他对萨姆·罗森曼和阿道夫·伯利起草的讲稿作了一遍又一遍的修改。晚上11点，罗斯福上床就寝，但是格雷斯·塔利和罗森曼一直工作到凌晨两点钟左右。早晨七点他们又起床，走进总统的卧室，在那里工作了整整一上午。罗斯福坐在床上，周围放满了文件。他逐页审阅讲稿，在审阅完之后，就交给塔利小姐用打字机重打一遍。他在电话中同赫尔商量过几次，讲稿的最后文本直到下午两点钟发表之前不久才定了下来。
罗斯福不出头露面，而让支持政府的人去带头进行争取废除禁运的斗争。加拿大总督特威兹穆尔勋爵（《三十九级台阶》和其他惊险小说的作者约翰·巴肯）建议要他“悄悄前往”海德公园村讨论欧洲时局，而总统却坚持推迟一段时间，他说：“我简直是如履薄冰。我向国会提交了一份咨文，这项法案有可能如愿获得通过，此刻我什么都不说，什么都不看，什么都不听。”虽然如此，他还是在幕后领导着这场斗争。他鼓励威廉·艾伦·怀特组织一个全国性的通过修正中立法获取和平的无党派委员会，同孤立主义的论点进行针锋相对的斗争，并且削弱库格林的吸引力。他还亲自敦促天主教会和劳工组织领导人支持废除禁运的措施。六个星期的辩论以总统的显著胜利而告终。现在盟国需要什么物品，就可以在美国购买什么物品，比如火炮、飞机和坦克，只要盟国支付现金，并用自己的船只将补给品运走就行。
10月11日，总统接见了来访的亚历山大·萨克斯。他是一位同“新政”有联系的经济学家，也是艾伯特·爱因斯坦的朋友。萨克斯带来了这位杰出的数学家的一封信和另一位难民科学家利奥·西拉德的一份备忘录，罗斯福从这封信和备忘录中获悉，德国在核裂变方面取得了成就，总统对这个神秘领域一无所知，而且思虑重重，所以对此漠不关心。萨克斯担心，罗斯福可能将这些函件束之高阁，不加以仔细研究，因此他坚持大声朗读一遍。爱因斯坦说：“这种新现象还可能导致制造一种炸弹，不难想象，一种威力极大的新型炸弹可能会被制造出来。”这引起了罗斯福的好奇心，他说：“亚历克斯，那么你们追求的就是保证纳粹无力把我们炸毁。”
“正是这样。”
罗斯福对沃森将军说：“帕，真需要采取行动。”从此萨克斯同国家标准局局长莱曼·J·布里格斯博士之间建立了联系，铀问题咨询委员会随即成立起来，由它的军事和科研人员去探讨这个问题。
1940年3月，在华盛顿新闻记者俱乐部一年一度的夜宴上，一尊用制型纸复制的塑有富兰克林·罗斯福肖像的狮身人面大雕像凝视着来宾。这尊雕像现出一副淘气的笑脸，得意地斜叼着烟嘴，嘲笑着在座的新闻记者和政客。1937年1月，总统的最后几句誓言还没有被人忘记，人们就开始揣测总统是否会竞选第三届总统，然而这尊不可思议的美国人面狮身大雕像坚决不去破解这个谜。表明这个揣测的新闻记者遵命“戴上圆锥形纸帽，靠边挨罚站”。由于7月15日即将在芝加哥召开的民主党全国代表大会日益临近，设法摸清罗斯福的计划已经成为举国关注的事情。内阁成员和白宫助手同一般公众一样猜不中谜底，他们就根据同总统谈话的片断热烈地交换意见。甚至他夫人都不能肯定他拟订什么计划；直至1940年春天她还以为他不会再次参与竞选活动。
未来的继任者颇不乏人。据云，副总统加纳和除开弗朗西丝·珀金斯以外的全体阁僚，都在不同时期参与竞选，但是哈里·霍普金斯似乎是总统一手挑选的继任者。1938年12月，他采取了树立霍普金斯个人威信的第一个措施，委任他为商务部长，希望他能赢得企业界人士的信任，因为他担任工程兴办局局长时挥霍成性的履历曾经惊动企业界。总统只要公开露面，就一定把霍普金斯带在身边。总统夫人也在她的专栏中对霍普金斯倍加称颂。霍普金斯短暂的走运由于身体欠适而终结。罗斯福还鼓励华莱士、证券交易委员会主席威廉·O·道格拉斯和司法部长罗伯特·杰克逊参加竞选。加纳·法利和赫尔在保守派当中拥有一批追随者。候选人中还包括前印第安纳州州长保罗·V·麦克纳特和参议员伯顿·惠勒。但是，由于罗斯福拒不明确表示自己的意图，他们都无法放出试探气球。1940年1月和2月举行的盖洛普民意测验表明，78%的民主党人赞成重新提名罗斯福为总统候选人，而他的主要对手加纳的支持者只10%的票数。
盟军在德军闪电战的迅速攻势面前节节败退，因此纷纷要求美国提供飞机、兵舰、大炮和弹药。德军的猛烈攻势使美国人目瞪口呆。以前，他们由于同欧洲的危险隔离而产生的舒适感如今已成为泡影。虽然在政策问题上的辩论仍在持续中，但是人人都认识到，纳粹的胜利危及美国的安全。
罗斯福建议大规模增强美国陆军和海军威力，就中包括实现每年制造五万架飞机的前所未闻的目标。5月16日，他对国会说，因为敌人拥有远程轰炸机，机械化部队、伞兵部队并且利用叛国分子，美国人民必须重新考虑如何保卫祖国的问题。
为防止在连任三届问题上的争论影响提名，罗斯福的支持者们打算指定他为总统候选人，而不采取点名投票的方式。但是，这种方法有一些问题。加纳和法利这两个仍在竞选的候选人应首先同意将自己除名。7月7日，即民主党代表大会在芝加哥开幕前一周，法利驱车前往海德公园，心情很不舒畅。最近几年，因为他认为罗斯福的激进主义思想日益严重，他和总统不知不觉地疏远了。他已不再应邀去白宫出席早晨的床边会议。当他的电话铃响起来的时候，他也听不到对方那熟悉的声音了。他们之间的关系一直是政治性的，而不是社交性的，法利已公开表示，他不在乎从白宫内圈中被排挤出去。但是，他内心感到痛苦，因为他怀疑罗斯福在社交方面对他非一视同仁。
新政分子和城市党魁们掌握的票数足以使总统在这次竞选中赢得胜利。提交大会的名单上除了有总统的名字以外，还有法利、加纳和米勒德·泰丁斯的名字，但是投票结果原属意料中事。罗斯福得到946票，法利72票，加纳61票，泰丁斯9票。票数清点完毕之后，法利扛着在明亮的灯光映照下闪闪发光的秃脑袋，从人群中挤到主席台上，提议大会一致通过总统候选人提名。会场上发出了普遍表示同意的喊声。提名不是指定的，然而总统候选人得到的选票接近于指定提名的选票。
罗斯福在海德公园同家庭成员和亲戚朋友们一起等待大选的结果。萨拉·罗斯福和几位老太太在靠近前门的一间小客厅里一边织毛衣，一边聊天，几乎没有注意听电台用柔和的声音播送的投票结果。大部分客人在那间图书室兼起居室的房间里踱来踱去。那里也有一架收音机，可以收听到大选的实况。罗斯福穿着衬衫，在餐厅里准备好了计票单和新闻自动收报机。埃莉诺从一个房间走到另一个房间，照看着所有的客人，似乎根本没有注意电台的广播。
到了10点钟，结果清楚了，他将以大多数票获胜。他而且担心，若是他落选，那就可能被视为绥靖政策的胜利，他对他夫人的朋友约瑟夫·拉希说：“乔，我们似乎防止了一场暴动。”总统和客人走到门廊去迎接海德公园邻居们举行的火炬游行。当天晚上，罗斯福格外兴奋，因为只有这一次他才在一贯投共和党票的选区内获胜。当罗斯福看到一幅仓促刷写的标语上写着“有把握连任三届”的时候，他尽情地笑了。
