石闵正式接管军营之后，对内务进行了整改，起先很多士兵都不明白这个少君侯是中了什么魔怔，提出什么内务整顿，但是当他们看到整整齐齐的就明白了。训练也是怎么也不明白连那些立正什么有什么用，不如多练一些武艺，甚至连那些武将都一个劲的报怨，他为什么也要参加训练。石闵一个不见，也不做解释。就是反复让他们练，违反军法，现场格杀，军法官就直接拿着刀站在旁边，训练他们的自然都是石闵亲兵。
但是不解释，不等于他们就没有怨气，他们白天训练完，晚上有一个屯哗变了，但是石闵早就看出来了，命令亲兵严密监视，并做了准备，石闵把所有亲兵全部派出，分别到个营房去，起到约束的作用。此时大量的武器已经统一收缴，现在他们训练用的都是木棍，他们哗变使用的武器便是木棍，因此他们拿着木棍准备冲向石闵住所时，突然门开了，石闵端坐在堂中，看着他们，脸上没有丝毫的怒气，但是眼睛死死的盯着他们，一句话没有，原本哗变吵闹的声音诡异般的消失，空气似乎也停滞了一般，过了一会领头的屯长看着着石闵说了一句：“快动手，把君侯抓起来。”而此时已有部分士兵丢下棍子，喊着求饶，接着他们瞬间就被围了。当然他们为了哗变不可能没有准备，派人去点燃了厨房，但是很快就被灭了，也造成了部分骚乱，但是也很快就镇压下来。
之后石闵擂鼓聚将点兵，将所有兵马点齐，然后在校场上将哗变的那一屯聚集，然后将他们全部押到点将台下，众将和士兵皆以为他们会被斩，石闵让冉丘宣告了他们哗变的事情。石闵然后缓缓站到前面对着众将士说道：“军营哗变者斩，但闵初入军营，亦有治军不严之罪，故只诛首犯。”亲兵将他的话传遍全军，屯长被押到台上直接斩杀了。石闵接着说：“久不经战阵已生懈怠，闵焉能让尔等送命，今后谁操练懈怠重罚，传令年满四十者出列单独编营，其余也跑五里，落最后一屯全部看押起来，明早剩余人等跑十里。”石闵说完扬长而去。
是日，石闵在等着晨跑十里的士兵回营，石闵让前一千名先行用餐，直接就地整编，后一千名在行整编，最后一千在行整编。剩下的杂役也单独整编，然后安排就餐。打乱建制，重新整编，石闵才能对他们有一个合理的控制，毕竟固有的军队整体上他不清楚，也不能够有效的管理，现在正好可以通过重新整编，更换军队体制，改用在海东已经实施的什、属、率、营、旅团、师团，当然后面还有军团，不过现在目前还没有成建制的军团。而现在的编制是伍、什、屯、队、幢、军，屯是一百人，队两百人，幢一千人，而这里正好三千人，所以自成一军，在配备了一些差役，满打满算大概有四千人。石闵直接把这些差役也编入行伍单独成军。当然亲兵还是教官，不过职称没有变化，把伍长去掉了，然后有的伍长升了什长，有的什长升了属长，有的屯长升了率长，当然也有幢主升都帅、都尉的，石闵自任旅帅，但是没说。冉旭担任佐将，周成、李穆、朱保、陈遐等诸将担任参军。按照编制只能有一个参军，可是石闵整编之后，一些不信任的也都升职了，裁汰的老弱，部分训练新兵，因为有经验，部分则送回兰陵，担任地方武吏，同时也补充到执天司的商队或商业卫队，另外从兰陵在补充一些新兵，同时兰陵的驻军也在裁汰老弱。兰陵才十三万多人口，土地少，经过战争的洗礼，经济才恢复没多少，只能养活一万多军队，石瞻出征带走一半，结果就剩下三千多，剩下的一直留驻兰陵。
整编后是个加强旅团编制，命名为虎贲，最重要是解决武器装备，于是只好在工匠集中起来，去找了一些铁匠，成立了个临时工匠属，把那些残破的刀枪剑啥的回炉重造，同时石闵还跑去跟石虎要装备，石虎虽然不太愿意给，不过还是给了三百套铁甲、一千套皮甲。石闵后面就跑去各大将军哪去收破烂，然后回去交给工匠属，让他们带着修补，锻造，石闵告诉他们，这叫做“自己动手，丰衣足食”，最后勉强凑齐了三千多人的甲，但是铁甲也就一千多，很多是其它军队淘汰的旧甲修补，其他都是皮甲。刀剑矛这些倒是稍微多点，弓箭不多，但是后期还可以在造，战力在不断提升。
